院系概况
电子工程系、大气与遥感系、理学系、计算机系、经济与贸易系、自动控制系、公共管理系、外语系、会计系、花旗营校区（南京陆军指挥学院—信息管理分院）
2013年新增加专业：金融工程，数字媒体艺术。
大气与遥感系
大气科学
该专业依托南京信息工程大学江苏省品牌、国家特色专业、全国重点学科——大气科学专业而设置的，师资力量雄厚，教学、实验、实习设备齐全。该专业培养具有扎实的大气科学基础理论、基本知识和基本技能，特别重视实际业务能力培养，能适应气象系统以探测为基础、预报为中心、服务为重点的工作所需要的应用型高级专门人才。主要课程有：高等数学、普通物理、计算机基础、英语、大气物理学、大气探测、流体力学、天气学原理、动力气象学、中国天气、数值天气预报、气象统计预报、现代气候学、应用气象学、气象服务、雷达气象、卫星气象等。
学生毕业后可以在气象、民航、海洋、水电、能源、科研、院校、部队等部门从事相关的业务、管理、教学和科研工作。
安全工程（雷电防护科学与技术）
该专业以雷电防护科学与技术方向为主，培养具有扎实的电气电子技术、信息系统和雷电科学与防护的基础理论、基本知识和基本技能，能从事雷电监测预警、防雷技术开发与应用、防雷工程设计、方案审核、防雷施工、检测验收、雷电灾害风险评估、防雷管理等工作的德、智、体、美全面发展的高素质、应用型、创业型的中、高级工程技术人才。主要专业课程有安全管理及其系统方法，雷电原理、电磁场理论、电磁兼容原理与设计技术、低压电气系统、建筑物防雷、接地技术、灾害评估等。
毕业生可在气象部门、研究所、防雷公司、大中型企事业单位等从事通信与计算机网络维护、雷电物理研究、防雷业务管理、防雷技术开发与应用、防雷工程设计与施工、防雷工程方案审核、检测验收和雷电灾害风险评估等工作。
遥感科学与技术
本专业培养具有系统、完整的遥感基础理论与基本技能，能够在大气、海洋、环境、陆地等领域综合应用遥感技术的应用型专业人才。主干课程有：遥感物理基础、遥感原理、遥感数字图像处理、辐射传输理论、定量遥感、高光谱与高空间分辨率遥感、微波遥感、热红外遥感、地理信息系统原理、全球定位系统、自然地理学、地图学、地统计学等。
学生毕业后可在气象、国防、资源、环境、土地、规划、计划等部门和高校、科研机构、从事相关的业务、科研、应用技术开发和管理等工作。
测绘工程
测绘科学研究的主要对象是地球的形状、大小和地表上各种物体的几何形状及其空间位置。学生在校期间主要的专业课程有：测量学、遥感原理、AUTOCAD基础、误差理论与测量平差、地理信息系统原理、大地（控制）测量基础、地图学、大比例尺数字测图原理及应用、地籍与房产测绘、GPS原理及其数据处理、摄影测量与遥感、海洋测绘、工程测量学等。测绘学注重实践，学生在教学任务内需熟练掌握水准仪、经纬仪、全站仪、静态GPS及RTK（实时动态差分系统）上述仪器的使用并进行实习。
学生毕业后可在测绘部门、国土资源、城市建设规划与管理、地震地质、交通、房产、工业企业、海洋、航空航天、建筑、水利、电力、国防、工程勘察、城市与企业信息管理等部门从事测绘及相关信息工程的规划、设计、实施与管理工作，也可以在政府部门、高等院校和科研单位从事相关工作。