院系设置
截止2014年，学校设有学院22个，涵盖农学、理学、工学、经济学、管理学、医学、文学、教育学、法学、艺术学10大学科门类，在84个本科专业招生。
学院（研究院）系（研究室）
农学院作物遗传育种学系、作物栽培与耕作学系、特种植物生产学系、植物生理学系、农业昆虫与农药学系、植物病理学系、生物技术系、生态农业与区域发展系
经济管理学院农业经济与公共管理系、财务与会计系、金融系、工商管理系、经济与贸易系
资源与环境学院土壤与植物营养学系、土地资源与信息技术系、环境科学与工程系、气象与生态学系、微生物学系
风景园林学院园林系、景观设计系、艺术设计系
动物科技学院
动物科学系、野生动物保护系、草业科学系、水产养殖系
动物医学院基础兽医系、预防兽医系、临床兽医系、药学系、动植物检疫系
林学院 林学系、木材科学与工程系、森林资源保护与游憩系、水土保持与荒漠化防治系
园艺学院园艺系、设施农业科学与工程系、茶学系
机电学院农业机械化系、电气化系、工程基础系
食品学院食品科学与工程系、食品质量与安全系
信息工程学院计算机科学系、信息工程系
水利水电学院农业水利工程系、水利水电工程系、农业建筑环境与能源工程系
生命科学学院生物化学与分子生物学系、动物学系、植物学系、生物工程及应用生物学系、101研究室（原子能农业应用研究室）
理学院应用化学系、应用物理系、应用数学系、基础教学部
文法学院英语系、人力资源管理系、法学系、汉语言文学系、政治系、社会工作系、文化产业管理系、公共外语系
政治学院思想政治教育系
艺术与体育学院体育系、设计艺术系、传播艺术系、教育技术系、基础教学部
建筑与城乡规划学院建筑系、城乡规划系、管理科学与工程系
土木工程学院建筑工程系、岩土与地下工程系、道路与桥梁工程系、市政工程系
旅游学院旅游管理系、资源保护与生态旅游系、旅游产品与教育技术系
商学院工商管理系、电子商务系、人文科学系、理学系、
独立研究所动物营养研究所、水稻研究所、玉米研究所、小麦研究所、动物遗传育种研究所、预防兽医研究所、生态林业研究所、生态环境研究所、果蔬研究所、园林研究所
其余研究院（中心）新农村发展研究院、远程与继续教育学院、四川省农村发展研究中心、四川省农业特色品牌开发与传播研究中心、德国研究中心、西南作物育种工程研究中心、动物抗病营养生物技术工程研究中心、西南玉米技术创新中心、四川省农业生物技术工程研究中心、四川省环境保护农村环境保护工程技术中心、四川省风景园林艺术设计工程研究中心、村镇建设防灾减灾工程研究中心、川猪产业升级与猪肉安全协同创新中心